Il-Kristjanizzazzjoni tal-Yaquis kienet dik li ppermettiet lir-reliġjużi jinfirxu fl-1609, u jippenetraw it-territorju ta 'Sonora.
Matul il-Kolonja, Sonora kienet tikkorrispondi biss għall-għoljiet tas-Sierra Madre Occidental inklużi fil-limiti ta 'dik l-entità. Ir-reġjun li kien imexxi lejn it-tramuntana mix-Xmara Yaqui, inkluż ir-Real de la Cieneguilla, kien jissejjaħ Pimería Baja u r-reġjun l-iktar fit-tramuntana minn dak ir-Real sal-Xmara Colorado - diġà fl-istat attwali ta ’l-Amerika ta’ Fuq ta ’Arizona - kien imsejjaħ Pimería Alta.
It-territorju attwali ta 'Sonoran jinkludi wkoll reġjun żgħir fil-Lbiċ ta' dak li dak iż-żmien kien magħruf bħala Pimería, li jinsab fl-istat ta 'Chihuahua u Ostimuri, post li jinsab fuq il-kosti tal-Golf ta' California, bejn ix-xmajjar Mayo u Yaqui.
Fl-1614 il-missjunarji Pérez de Rivas u Pedro Méndez Kristjaneżizzaw il-Mayans fiż-żona ta ’Ostimuri, u qasmu l-missjoni fi tliet Distretti: Santa Cruz (fil-bokka ta’ Mayo), Navojoa u Tesia.
It-Tepahues ġew inkorporati flimkien mal-Cornicaris fl-1620. Patri Miguel Godínez waqqaf il-missjonijiet ta 'San Andrés de Cornicari u l-Asunción de Tepahui . Dik l-istess sena twaqqfet ir-Rettorat ta 'San Ignacio, li kien jinkludi, minbarra l-ħames missjonijiet imsemmija qabel, dawk ta' Bacúm, Torín u Rahún, li jinsabu fil-bokka tal-Yaqui.
Fl-1617 il-Yaquis ġew ikkonvertiti mill-ġenituri Pérez de Rivas u Tomás Basilio. Minkejja tbatija rewwixti, rewwixti, turmenti u omiċidji, il-konverżjoni ta 'Sonora kienet aktar mgħaġġla u aktar sigura. Fis-seklu 17 il-Ġiżwiti espandew u waqqfu l-missjoni ta 'Maycoba u Yecora fil-parti tal-Lbiċ ta' dak li kienu jafu bħala Chínipas.
Il-missjonijiet mix-Xmara Yaqui lejn it-tramuntana kienu maqsuma f'erba 'rettorji: San Borja ġabar il-missjonijiet ta': Cucumaripa u Tecoripa , imwaqqfa fl-1619; Movas u Onovas, fl-1622; Sahuaripa fl-1627; Matape fl-1629; Onapa fl-1677 u Arivechi , fl-1727. Ir-Rettorat tat-Tliet Martri Mqaddsa tal-Ġappun li kien jinkludi Batuco mwaqqaf fl-1627, Oposura fl-1640 u Bacadeguachi , Guazavas , Santa Marija Baceraca u San Miguel Bavispe , imwaqqfa fl-1645. U r-Rettorat ta 'San Javier li integrat il-missjonijiet ta' Ures fl-1636; Aconchi, Opodepe u Banámichi fl-1639; Cucurpe u Arizpe fl-1648, u Cuaquiárachi fl-1655.
Fl-1687, il-missjunarju Eusebio Francisco Kino daħal fil-Pimería Alta u beda l-missjonijiet tar-Rettorat ta ’Nuestra Señora de los Dolores, billi waqqaf: Caborca, li għalih ġie assenjat Francisco Javier Saeta li jżomm korrispondenza bl-appoġġ spiritwali tiegħu, Missier Kino; Atil, Tubutama, il-Madonna tad-Duluri minn Saric, Pitiquito, Aiil, Oquitoa, Magdalena, San Ignacio, Cocóspera u Imuris.
Wara t-tkeċċija tal-Ġiżwiti, il-missjonijiet tħallew f'idejn il-Franġiskani, li ma bnewx iktar u llimitaw ruħhom biss biex jippruvaw jippreservaw dawk eżistenti. Ladarba l-Ġiżwiti kienu diġà stabbilixxew insedjamenti f'Sinaloa u Sonora, daru għajnejhom lejn it-territorju Kalifornjan.
